بخلاف شركات الشحن والتفريغ التقليدية، لا تقتصر الشركة الوطنية لإدارة الموانئ على تداول بضائع الصب الجاف في الموانئ البحرية الرئيسية في مصر، بل تقدم حلولًا تشغيلية مصممة وفقًا لخصوصية كل ميناء، من خلال نموذج التفريغ في مناطق المخطاف، بما يتيح للسفن التفريغ بكفاءة رغم ازدحام الأرصفة أو قيود الغاطس.
وتفريغ البضائع الجافة السائبة والتخزين بخلاف شركات الشحن والتفريغ التقليدية، لا تقتصر الشركة الوطنية لإدارة الموانئ على مناولة البضائع الجافة السائبة في الموانئ البحرية الرئيسية في مصر، بل تقدم حلولًا تشغيلية مصممة وفقًا لخصوصية كل ميناء، من خلال نموذج التفريغ في مناطق المخطاف، بما يتيح للسفن التفريغ بكفاءة رغم ازدحام الأرصفة أو قيود الغاطس. في ميناء الإسكندرية، تطور هذا النموذج ليصبح منظومة لوجستية متكاملة متعددة الوسائط متكاملة، تسهم في تقليل الضغط على الميناء، وتحسين زمن دوران السفن، وضمان استمرارية تدفق البضائع ومرونة سلسلة الإمداد. وقد كانت الشركة رائدة في الربط بين التفريغ البحري خارج الأرصفة وحلول النقل بالبارجات ومرافق التخزين على امتداد قناة النوبارية، وصولًا إلى شبكة نهر النيل ومراكز التوزيع الداخلية.

أما في ميناء الأدبية، فتتيح العمليات البحرية في مناطق المخطاف للتجار الاستفادة من سفن أكبر حجمًا لتحقيق كفاءة أعلى في تكاليف الشحن، رغم قيود الغاطس، وذلك باستخدام الأوناش العائمة لتفريغ البضائع علي البارجات ونقلها لرصيف الميناء.

كما تمتد عمليات الشركة إلى مينائي الدخيلة ودمياط من خلال مرافق تخزين ومناولة مخصصة.